公司违约赔偿不一定按总收入。依据《民法典》，赔偿一般按合同约定，无约定则按实际损失计算。不及时处理可能导致损失扩大，影响权益。
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公司违约处理如下：
1. 协商：首先尝试与对方沟通，达成赔偿协议。
2. 诉讼：若协商无果，可向法院提起诉讼，依据《民法典》要求赔偿。
3. 仲裁：也可选择仲裁机构，按程序申请仲裁，解决赔偿纠纷。

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